Le projet Biobanque Cohortes Françaises (BioCF) ambitionne de bâtir, au sein de la Fondation Jean Dausset-Centre d’Étude du Polymorphisme Humain (CEPH), une infrastructure nationale centralisée pour collecter, stocker et exploiter les échantillons biologiques de cinq cohortes généralistes françaises : Constances, Gazel, E3N-Générations, Elfe et Epipage 2.
Il bénéficie d’une aide de l’État géré par l’Agence nationale de la recherche (ANR) au titre du programme Investissement d’Avenir (PIA) et plus particulièrement via le dispositif EQUIPEX+ «Équipements d’Excellence» obtenu en 2020. Ce dispositif a été mis en place pour financer des projets innovants et d’excellence dans différents domaines, notamment la recherche.
Ce projet s’appuie sur les équipements matériels existants et nouveaux, les échantillons biologiques des cohortes et les équipements nécessaires à leur conservation et leur traitement. Sans oublier les vastes équipements immatériels tels que les données des cohortes et le savoir-faire technique et scientifique du centre de ressources biologiques (CRB) du CEPH à Paris.
Tout cela permettant de mutualiser et partager des données à grande échelle, d’offrir des opportunités aux chercheurs académiques et du secteur privé dans le domaine de la recherche en santé, le tout en garantissant un stockage de très haute qualité.
Plusieurs work-packages ont été constitués pour répondre aux objectifs du projet :
- WP1 – établir une forte collaboration autour des collections biologiques des 5 cohortes
- WP2 – centraliser les biobanques au CEPH
- WP3 – créer un leadership en «science du biobanking»
- WP4 – établir les collections biologiques pour les générations 2 et 3 de la cohorte E3N-Générations pour environ 20 000 familles
- WP5 – effectuer le génotypage à large échelle (~150 000 personnes) des 5 cohortes
- WP6 – créer un catalogue des échantillons et des données disponibles pour en promouvoir l’utilisation pour des projets de recherche de qualité
Une ressource nationale centralisée
Quelle est la valeur ajoutée de BioCF sur la scène internationale ?
«Notre atout, par rapport à des initiatives similaires à l’international et notamment le projet UKBiobank, est que nous disposons de données collectées de manière répétée sur plusieurs aspects de la vie et de la santé des participants et sur plusieurs années de suivi. Nos cohortes couvrent différentes générations et phases de la vie, à partir de la période fœtale.» Gianluca SEVERI